Pleiskirchen liegt im hügeligen Holzland, ca. 90 km östlich von München und 15 km nördlich von Altötting. Die Gemeinde ist der nördlichste Ausläufer des Landkreises Altötting und grenzt an den Landkreis Mühldorf a. Inn im Westen und den niederbayerischen Landkreis Rottal-Inn im Osten.

Von Pleiskirchen sind es nur ca. 50 km zum „Bäderdreieck“ Bad Birnbach – Bad Griesbach – Bad Füssing. In einer Stunde sind auch Salzburg und die Chiemgauer Alpen erreichbar.

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